El Programa de Magíster en Ciencias Agronómicas contribuye a la formación de recurso humano del área agropecuaria y afines, con capacidades en investigación que permitan a las reparticiones públicas, empresas privadas, centros educacionales técnicos, universidades o centros de investigación regionales y nacionales disponer de capital humano que pueda aportar a la modernización e innovación, al ampliar y profundizar sus conocimientos con respecto a los adquiridos en el pregrado. Al formar graduados en un programa como el presente, la Universidad contribuye al desarrollo no sólo de la ciencia en Chile, sino también a resolver problemas en el ámbito agroalimentario en el país, para lo cual la sociedad requiere de las ciencias, la tecnología y la innovación. Esto es particularmente importante, considerando que la agricultura actual debe hacer frente al cambio climático. Esto último se ve reflejado en las áreas de estudio del programa que han sido adaptadas a las necesidades ambientales, tecnológicas, sociales y culturales del país.
Formar graduados con competencias para identificar problemas científicos o tecnológicos en el ámbito de las ciencias agronómicas, con el fin de proponer, elaborar y comunicar soluciones generadas a partir de la investigación, incorporando nuevas tecnologías, con un enfoque en el manejo sustentable de los recursos naturales para la producción agrícola de calidad en un contexto de seguridad e inocuidad alimentaria y cambio climático.