Magíster en Ciencias con Mención en Pesquerías

Curso en que el alumno pone en práctica y refuerza áreas específicas en los conocimientos y habilidades alcanzadas durante el magíster y en el que se incentiva el desarrollo de nuevas investigaciones en el campo de las pesquerías. El curso es tutorial y para su desarrollo se propondrá un área temática de investigación acordada entre el alumno y el profesor que será informada por el alumno al inicio del semestre mediante una carta al director del programa. Si lo cursan alumnos de segundo año, la temática de investigación deberá ser concordante con los planes de su proyecto de tesis. La modalidad de investigación y trabajo del alumno (clases teóricas o prácticas, análisis de laboratorio, de datos o instigación bibliográfico) serán acordadas entre el profesor y el estudiante.

Esta asignatura se concentra fundamentalmente en herramientas cuantitativas utilizadas principalmente en ecología de poblaciones y evaluación de stock. Capacita al alumno en la aplicación correcta de conceptos y técnicas matemáticas como estadísticas orientadas a la estimación de parámetros de historia de vida, como crecimiento, mortalidad, madurez sexual, evaluación de tamaño poblacional, cuantificar la incertidumbre asociada a la situación actual de poblaciones. Por su implicancia se pretende que el alumno comprenda el cálculo diferencial e integral y su aplicación. Además se capacitará al alumno para que describa los tipos de modelos matemáticos y técnicas estadísticas, particularmente probabilidad, distribución de probabilidad, método monte carlo, regresión lineal y no-lineal, suma de cuadrados, principios de verosimilitud, bootstrap, modelos lineales generalizados, modelos aditivos generalizados, análisis bayesiano, y técnicas de selección de modelos. A través de la asignatura se utiliza un programa estadístico moderno, r (http://cran. Es. R-project. Org/), para trabajar con datos reales, obtener resultados y comunicar los hallazgos, fortalezas y debilidades de los mismos.

Asignatura profesional en la que se tratan conceptos teóricos y prácticos de la dinámica de poblaciones marinas explotadas en el contexto de la restauración biológica de poblaciones de recursos que han sido agotadas por efectos de una pesca intensa. Capacita al alumno para diseñar planes de recuperación de pesquerías desde el punto de vista biológico, considerando la vigilancia y el control de indicadores poblacionales, el establecimiento de puntos biológicos de referencia para la recuperación biológica, y la evaluación bajo incertidumbre de los planes de recuperación según escenarios biológico poblacionales plausibles. Asimismo orienta al alumno sobre las consecuencias de la pesca sobre la capacidad reproductiva de las poblaciones marinas. Esta asignatura contribuye con la siguiente competencia al perfil de egreso del biólogo marino: manejo y conservación de recursos marinos.

El enfoque poblacional para la recuperación de stock implica conocer conceptos teóricos y prácticos de la dinámica de poblaciones marinas explotadas en el contexto de la recuperación biológica de los stocks que han sido agotados por efectos de una pesca intensa. En este contexto, la asignatura pretende capacitar en la evaluación de estrategias de explotación transitorias, tiempos de recuperación y probabilidad de recuperación biológica, considerando un enfoque probabilístico en un horizonte de tiempo dado. El enfoque para la recuperación de stock aporta al diseño de planes de recuperación de pesquerías desde el punto de vista biológico, considerando la vigilancia y el control de indicadores poblacionales y puntos biológicos de referencia. Asimismo orienta al alumno sobre las consecuencias de la pesca y la capacidad reproductiva de las poblaciones marinas. Esta asignatura contribuye con al perfil de egreso en términos de las habilidades en el manejo conceptual, metodológico e intervención de situaciones asociadas a procesos biológicos y pesqueros de poblaciones con interés económico. Asimismo, en la capacidad de interpretar y analizar críticamente problemas complejos en su ámbito de acción.

El manejo pesquero se sustenta en objetivos de manejo que se operativizan a través de procedimientos de manejo, siendo estos últimos definidos como el conjunto comprendido entre: a) un sistema de monitoreo para recolectar datos, b) un estimador de la situación del stock, ya sea un modelo de evaluación o un indicador; y c) una regla de control de la explotación, ya sea basada en mortalidad por pesca o capturas. La regla de control de la explotación se basa en estrategias de explotación genéricas, y se definen según umbrales o puntos biológicos de referencia objetivos y límites. El desempeño de la estrategia de explotación o de los procedimientos de manejo puede ser evaluado bajo el enfoque de evaluación de estrategias de manejo, que requiere un modelo operativo tal que permita simular el procedimiento de manejo en su totalidad. Una de las herramientas que permite realizar eem es ad model builder (admb) (http://www. Admb-project. Org/), y esta asignatura pretende capacitar la implementación de eem con admb y orientar al estudiante sobre las consecuencias de la pesca y la capacidad reproductiva de las poblaciones marinas. Esta asignatura contribuye con al perfil de egreso en términos de las habilidades en el manejo conceptual, metodológico e intervención de situaciones asociadas a procesos biológicos y pesqueros de poblaciones con interés económico. Asimismo, en la capacidad de interpretar y analizar críticamente problemas complejos en su ámbito de acción.

El curso de bioestadística avanzada considera conceptos teórico-prácticos para el análisis correcto de datos biológicos y ecológicos. El curso está orientado a capacitar a estudiantes de postgrado y estudiantes de nivel superior en aplicar métodos de inferencia, modelamiento y estimación de parámetros poblacionales. Se utiliza un programa estadístico moderno denominado r (http://cran. Es. R-project. Org/) para trabajar con datos reales, obtener resultados y comunicar los hallazgos, fortalezas y debilidades de los mismos. El curso aporta al manejo de conceptos teóricos y herramientas cuantitativas al manejo y conservación de recursos acuáticos renovables. Esta asignatura aporta con las siguientes competencias del graduado: • manejar conceptos teóricos y herramientas metodológicas en la evaluación cuantitativa de poblaciones acuáticas renovables y su desarrollo biotecnológico. • comunicar en forma oral y escrita conocimiento científico y tecnológico en diferentes contextos a nivel nacional e internacional.

Asignatura destinada a entregar al alumno de postgrado herramientas teóricas y prácticas para el análisis de procesos oceanográficos que afectan la distribución, abundancia y sobrevivencia de recursos marinos vivos durante su período pre-recluta (huevos, larvas y juveniles). Los alumnos tendrán acceso muestras de estadios de desarrollo temprano de recursos marinos y/o a una base de datos oceanográficos y de distribución de organismos para trabajar durante el semestre. Al final del curso el alumno es capaz de identificar distintos tipos de procesos oceanográficos, principalmente físicos y biológicos de diferente escala espacial y temporal que afectan a los recursos en sus estadios pre-reclutas, así como a diseñar y llevar a cabo investigaciones tendientes a explicar la asociación entre los procesos oceanográficos y la sobrevivencia de pre-reclutas.

El enfoque poblacional para la recuperación de stock implica conocer conceptos teóricos y prácticos de la dinámica de poblaciones marinas explotadas en el contexto de la recuperación biológica de los stocks que han sido agotados por efectos de una pesca intensa. En esta asignatura se utilizan estrategias de explotación transitorias para la recuperación de stocks, se cuantifica los tiempos de recuperación y la probabilidad de recuperación biológica, considerando un enfoque probabilístico a través de la proyección de la abundancia en el largo plazo. El enfoque poblacional para la recuperación de pesquerías aporta al diseño de planes de recuperación de pesquerías desde el punto de vista biológico, considerando la vigilancia y el control de indicadores poblacionales y puntos biológicos de referencia. Asimismo, orienta al alumno sobre las consecuencias de la pesca y la capacidad reproductiva de las poblaciones marinas.

El manejo pesquero se identifican procedimientos de manejo (pm), definidos por: a) un sistema de recolección de datos, b) un estimador de la situación del stock, o indicador; y c) una regla de control de captura. La regla de control se basa en estrategias de explotación genéricas, y puntos biológicos de referencia objetivos y límites. Muchas de las pesquerías actuales carecen de observaciones sistemáticas de datos, lo que impone desafíos para la evaluación y manejo. En esta asignatura, se capacitará en la aplicación de modelos de evaluación de pesquerías limitadas en datos.

Bioenergetics models provide a useful framework for mechanistically determining what factors affect feeding and growth of aquatic organisms and for quantifying consumption under dynamic environmental and ecological conditions. These models allow us to examine what factors limit populations of interest (seasonal food supply, predation, competition, environmental conditions). In this course, you will acquire a conceptual understanding of bioenergetics principles, then learn to construct and apply bioenergetics models for fish and/or invertebrates to a wide array of management and research questions about trophic interactions, design supporting studies, and critically examine this approach and others through lecture, literature discussion, computer exercises, and projects.

La modelación estadística de los datos colectados por ecólogos y biólogos de las ciencias de mar de poblaciones naturales requiere del conocimiento de conceptos, métodos y herramientas de análisis matemático, estadístico y programacionales de los datos colectados, tanto en experimentos de laboratorio como en estudios observacionales en la naturaleza. Esta asignatura está orientado al desarrollo de herramientas cuantitativas para el análisis de datos ecológicos utilizando el lenguaje r, proporcionando a los estudiantes graduados las capacidades para analizar sus datos experimentales y observacionales para resolver preguntas de la dinámica de poblaciones tanto terrestres como marinas. La amplia experiencia del relator tanto en dinámica poblacional, modelación estadística y programación (autor de varias extensiones oficiales del lenguaje r) brindará a los estudiantes una cercanía tanto a los fundamentos como a la forma de resolver los problemas.

Esta asignatura entrega conocimiento y herramientas avanzadas para la gestión y manejo de recursos pesqueros con énfasis en un enfoque ecosistémico a la pesca, así como en una gobernanza pesquera entendida como parte integral de sistemas socio-ecológicos complejos. La asignatura analiza en profundidad los desafíos más importantes de la administración pesquera actual con especial énfasis en las pesquerías de chile y de ecosistemas de borde oriental. El enfoque general del curso está basado en el análisis de casos de estudio. La asignatura se inserta en los desafíos necesarios para cumplir los objetivos del desarrollo sostenible propuestos por naciones unidas para el 2030.

Esta asignatura se concentra fundamentalmente en herramientas cuantitativas utilizadas principalmente en ecología de poblaciones y pesquerías. Se tratarán conceptos matemáticos, estadísticos y de programación, así como aplicaciones y técnicas orientadas a la estimación de parámetros de historia de vida, evaluación de stock, y cuantificar la incertidumbre asociada a la situación actual de poblaciones. Para ello, se revisa el cálculo diferencial e integral y su aplicación, tipos de modelos matemáticos, modelos estadísticos. Asimismo, se utiliza un programa estadístico r (https://cran. R-project. Org) con rstudio (https://www. Rstudio. Com) para trabajar con casos de estudio, obtener resultados y comunicar los hallazgos, fortalezas y debilidades de los mismos.

El propósito principal del manejo de recursos pesqueros es fomentar la explotación racional de ellos, logrando su sustentabilidad en el largo plazo, así como de las pesquerías y otras actividades que de ellos dependen. El manejo pesquero es un proceso complejo que involucra una amplia variedad de grupos de interés, usualmente con diferentes orientaciones, conocimientos, roles y objetivos. La toma de decisiones en el manejo pesquero se beneficia del aporte de la ciencia respecto del conocimiento del estado y tendencia de los recursos, tanto del pasado como en el futuro, bajo decisiones alternativas de manejo. Tradicionalmente, el apoyo científico para el manejo de recursos pesqueros se ha basado en uno o un grupo reducido de modelos de dinámica poblacional que se considera reúnen los mejores supuestos, análisis y datos disponibles al momento de realizar las asesorías. Este enfoque ha resultado problemático debido a sesgos en los modelos, la variabilidad de sus resultados no relacionados a cambios poblacionales, inconstancia en la implementación de los resultados de los modelos en acciones de manejo, tendencia a un enfoque cortoplacista, incompleta o incorrecta incorporación de incertidumbre y riesgo. Las estrategias de manejo son las combinaciones integradas y pre acordadas de los datos, los análisis de esos datos y la regla de control de captura utilizada para determinar las acciones de manejo. El proceso de evaluación de estrategias de manejo (eem, o mse por sus siglas en ingles) es considerado el más apropiado para evaluar costos y beneficios esperados entre estrategias de manejo alternativas, integrando múltiples fuentes de incertidumbre, para lograr los objetivos de manejo propuestos. Aunque parte del proceso de evaluación de estrategias de manejo es altamente técnico y desarrollado por científicos cuantitativos a través de simulaciones computacionales, otra parte igualmente importante involucra a otros grupos de interés (tales como administradores, gente de la industria, los pescadores o sus representantes), por ejemplo en la definición de objetivos de manejo, las métricas de desempeño y las estrategias a evaluar. Vale decir, es fundamental que todos los participantes comprendan los elementos básicos, la mecánica y los roles de cada participante en el proceso de eem. La asignatura/taller propuesto tiene como capacitar a los estudiantes en los componentes, el diseño y el proceso de evaluación de estrategias de manejo de recursos pesqueros, tanto en aspectos genéricos, como también abordando casos de estudio particulares. La asignatura está organizada en una serie de sesiones virtuales de media jornada de duración, alternando sesiones teóricas conceptuales y sesiones prácticas donde se demostrará de manera interactiva casos genéricos y casos de estudio sobre diseño utilizando entre otros el paquete estadístico r, ms excel y la plataforma de modelado stock synthesis. Para las actividades demostrativas e interactivas también se utilizará una herramienta/aplicación shiny en línea (online), la cual simula el ciclo completo de evaluación de estrategias de manejo bajo diferentes supuestos y configuraciones de proyección y manejo.

Esta asignatura de carácter teórico (50%) y práctica (50%) les otorgará a los estudiantes una mejor comprensión de los procesos, fenómenos y eventos de carácter oceanográfico (ej. El niño, eventos de surgencia) y de los patrones y tendencias que presentan las series de tiempo pesqueras (ej. Abundancia, disponibilidad, cpue). Se otorgan a los estudiantes los fundamentos básicos de las herramientas utilizadas para el análisis de series temporales, para que estos desarrollen las competencias y habilidades prácticas necesarias para analizar series de tiempo pesqueras y/o oceanográficas. Se promueve el desarrollo de una visión crítica de los estudiantes, la cual les permitirá comprender de mejor forma la dinámica que presentan las observaciones que conforman las series de tiempo, y cuantificar el efecto de la variabilidad de series oceanográficas (ej. Stress del viento, caudal de ríos) sobre la dinámica de series pesqueras (ej. Reclutamiento).

Esta asignatura entregará a los alumnos las bases teóricas del ciclo de vida, comportamiento y las herramientas metodológicas prácticas en la evaluación y administración de salmones y truchas (i. E. , salmónidos; familia salmonidae), un carismático y bien estudiado grupo de peces originarios del hemisferio norte. Además de sustentar importantes pesquerías, los salmónidos son importantes sustratos de estudio en ecología y genética debido a (i) su variación en historias de vida, (ii) la extensa migración entre áreas de reproducción en aguas continentales y alimentación en aguas marinas, y (iii) la capacidad de retornar a desovar a los tributarios y/o lagos en que eclosionaron desde huevos 3 – 5 años antes. Se discutirá también las introducciones de salmónidos en el mundo, con énfasis en casos exitosos en varios continentes, donde hoy forman conspicuas poblaciones asilvestradas que han alterado significativamente los ecosistemas nativos, pero que benefician a comunidades de pescadores recreativos y artesanales.

El manejo pesquero se identifican procedimientos de manejo (pm), definidos por: a) un sistema de recolección de datos, b) un estimador de la situación del stock, o indicador; y c) una regla de control de captura. La regla de control se basa en estrategias de explotación genéricas, y puntos biológicos de referencia objetivos y límites. Muchas de las pesquerías actuales carecen de observaciones sistemáticas de datos, lo que impone desafíos para la evaluación y manejo. En esta asignatura, se capacitará en la aplicación de modelos de evaluación de pesquerías limitadas en datos.

La asignatura orientada al desarrollo de herramientas cuantitativas para el análisis de datos ecológicos utilizando plataformas de vanguardia en la estimación lineal y no lineal de parámetros. La plataforma “template model builder” (tmb) se propone como un recambio del prestigiado programa admb (automatic differentiation model builder, www. Admb-project. Org), que se puede operar íntegramente desde r y que permite implementar eficientemente complejos modelos estadísticos. En esta asignatura se implementarán modelos estadísticos y se aprenderá a ajustarlos mediante métodos de máxima verosimilitud. Estos modelos cubrirán un amplio rango, desde modelos con efectos fijos, aleatorios y mixtos (i. E. , modelos jerárquicos). Se trabajará con datos propios y de la asignatura para practicar el proceso de estimación de parámetros de modelos en r.

La acuicultura es una de las actividades económicas más importantes y en activo desarrollo en nuestro país. En particular el cultivo de salmones entrega una importante cantidad de divisas y se extiende geográficamente desde arica a magallanes. La asignatura aborda elementos generales del cultivo de peces, entregando las bases para profundizar en aspectos de su manejo, tales como reproducción, crecimiento, engorda y efecto de factores ambientales, entre otros, permitiendo realizar una evaluación de la producción racional de los recursos. Además, se ofrecen otros puntos de vista del cultivo como por ejemplo satisfacer necesidades sociales que van desde cultivos de carácter familiar, principalmente de subsistencia, actividades de cultivo con orientación hacia la conservación de recursos (repoblamiento), hasta el desarrollo de actividades comerciales de gran envergadura.

Asignatura destinada a entregar al alumno de postgrado herramientas teóricas y prácticas para el análisis de procesos oceanográficos que afectan la distribución, abundancia y sobrevivencia de recursos marinos vivos durante su período pre-recluta (huevos, larvas y juveniles). Los alumnos tendrán acceso a muestras de estadios de desarrollo temprano de recursos marinos y/o a una base de datos oceanográficos y de distribución de organismos para trabajar durante el semestre. Al final del curso el alumno es capaz de identificar distintos tipos de procesos oceanográficos, principalmente físicos y biológicos de diferente escala espacial y temporal que afectan a los recursos en sus estadios pre-reclutas, así como a diseñar y llevar a cabo investigaciones tendientes a explicar la asociación entre los procesos oceanográficos y la sobrevivencia de pre-reclutas.

La ecología molecular es un campo emergente de la biología evolutiva que utiliza la variación genética existente a nivel celular (i. E. , adn, arn y proteínas) para resolver preguntas de interés ecológico, como por ejemplo: (1) el diagnóstico de especies y poblaciones; (2) conservación de la biodiversidad sobre y bajo el nivel de especie; (3) estimación de patrones de dispersión en tiempo real y su direccionalidad; (4) caracterización de sistemas de apareamiento; (5) descripción de relaciones genotipo-ambiente; (6) estimación del tamaño poblacional y (7) metabarcoding ambiental para describir presencia y ausencia de especies. Durante el curso se discutirán y expondrán casos de estudio clásicos y recientes que han popularizado esta subdisciplina científica. La otra mitad del curso estará dedicada al aprendizaje de estos conceptos mediante aplicaciones prácticas, como el análisis de genotipos multilocus y el desarrollo de un trabajo de investigación.