El programa de Magíster en Historia fue creado el 2 de diciembre de 1991 e inició sus actividades académicas en 1992. Cuenta con una amplia trayectoria formando investigadores/as en ciencia histórica, a partir de competencias teóricas y metodológicas para desarrollar una profundización historiográfica crítica, creativa y actualizada en el conocimiento contemporáneo, tanto en contextos científico académicos como de vinculación del saber histórico con el entorno local y global. El programa procura preservar estándares de excelencia académica en la formación de sus graduados y graduadas y en la producción científica de sus docentes y graduados/as, propiciando además actividades vinculación con el medio que impulsan el desarrollo de la cultura y la reflexión crítica sobre la complejidad de los fenómenos históricos, a través de la comprensión del presente desde el estudio del pasado.
El objetivo general del Magíster en Historia es la formación de investigadores con competencias teóricas y metodológicas para desarrollar una profundización historiográfica crítica y creativa en el conocimiento contemporáneo, en las líneas de investigación que aborda el programa, comunicando conocimiento en contextos académicos y de vinculación con el medio.